Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
SEMA3BQ13214 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SEMA3BQ13214 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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