Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUSP4Q13115 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DUSP4Q13115 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.51■□□□□ 0.87
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