Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRDNQ13061 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
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