Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXL1Q12952 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms