Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPRJQ12913 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
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PTPRJQ12913 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PTPRJQ12913 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
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