Protein–RNA interactions for Protein: Q12908

SLC10A2, Ileal sodium/bile acid cotransporter, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC10A2Q12908 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC10A2Q12908 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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