Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
BPTFQ12830 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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