Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TROQ12816 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TROQ12816 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TROQ12816 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TROQ12816 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
TROQ12816 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
TROQ12816 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
TROQ12816 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
TROQ12816 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
TROQ12816 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
TROQ12816 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
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