Protein–RNA interactions for Protein: Q06889

EGR3, Early growth response protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR3Q06889 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
EGR3Q06889 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EGR3Q06889 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms