Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PAX8Q06710 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PAX8Q06710 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms