Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
RAD51Q06609 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RAD51Q06609 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms