Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
GABPAQ06546 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GABPAQ06546 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms