Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
EXOSC9Q06265 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
EXOSC9Q06265 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms