Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CHRNEQ04844 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CHRNEQ04844 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms