Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 WWOX-AS1-201ENST00000567099 443 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 ADAM20P2-201ENST00000515830 1273 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CACNB1Q02641 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 ZNF720-202ENST00000398696 1339 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC092685.1-201ENST00000447960 1243 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC138150.1-201ENST00000589950 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CACNB1Q02641 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms