Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
IRF8Q02556 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms