Protein–RNA interactions for Protein: Q01860

POU5F1, POU domain, class 5, transcription factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU5F1Q01860 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
POU5F1Q01860 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
POU5F1Q01860 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms