Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CACNA1DQ01668 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms