Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DEFA6Q01524 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms