Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SCN7AQ01118 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SCN7AQ01118 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms