Protein–RNA interactions for Protein: Q00604

NDP, Norrin, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDPQ00604 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NDPQ00604 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDPQ00604 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDPQ00604 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDPQ00604 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDPQ00604 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225.7 ms