Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
FANCCQ00597 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
FANCCQ00597 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms