Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CDKL1Q00532 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDKL1Q00532 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms