Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FGD1P98174 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FGD1P98174 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
FGD1P98174 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms