Protein–RNA interactions for Protein: P83916

CBX1, Chromobox protein homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P83916 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CBX1P83916 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CBX1P83916 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CBX1P83916 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms