Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IRX3P78415 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IRX3P78415 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IRX3P78415 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRX3P78415 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IRX3P78415 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IRX3P78415 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IRX3P78415 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms