Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF2IP78347 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF2IP78347 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms