Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ACTA1P68133 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ACTA1P68133 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms