Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HERVK_113P63132 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
HERVK_113P63132 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms