Protein–RNA interactions for Protein: P62857

RPS28, 40S ribosomal protein S28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS28P62857 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS28P62857 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
RPS28P62857 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ELK1-201ENST00000247161 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
RPS28P62857 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RPS28P62857 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms