Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RAB11AP62491 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms