Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
TMEM258P61165 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CCBE1-201ENST00000398179 5979 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
TMEM258P61165 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms