Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
UBE2NP61088 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms