Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMA6P60900 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms