Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPK4P57078 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPK4P57078 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPK4P57078 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPK4P57078 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPK4P57078 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RIPK4P57078 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RIPK4P57078 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms