Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ELLP55199 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ELLP55199 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ELLP55199 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms