Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

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Length 987 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EPHB4P54760 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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