Protein–RNA interactions for Protein: P51858

HDGF, Hepatoma-derived growth factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFP51858 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
HDGFP51858 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HDGFP51858 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HDGFP51858 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
HDGFP51858 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HDGFP51858 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HDGFP51858 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HDGFP51858 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HDGFP51858 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HDGFP51858 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms