Protein–RNA interactions for Protein: P51784

USP11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP11P51784 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
USP11P51784 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP11P51784 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP11P51784 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP11P51784 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
USP11P51784 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
USP11P51784 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
USP11P51784 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
USP11P51784 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
USP11P51784 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
USP11P51784 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms