Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
BRCA2P51587 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
BRCA2P51587 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms