Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IQGAP1P46940 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
IQGAP1P46940 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms