Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HTTP42858 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HTTP42858 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
HTTP42858 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HTTP42858 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
HTTP42858 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HTTP42858 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
HTTP42858 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
HTTP42858 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms