Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PIK3CBP42338 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms