Protein–RNA interactions for Protein: P41238

APOBEC1, C->U-editing enzyme APOBEC-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC1P41238 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
APOBEC1P41238 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms