Protein–RNA interactions for Protein: P41219

PRPH, Peripherin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPHP41219 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRPHP41219 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRPHP41219 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRPHP41219 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms