Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
ARL1P40616 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
ARL1P40616 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
ARL1P40616 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL1P40616 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL1P40616 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL1P40616 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL1P40616 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
ARL1P40616 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL1P40616 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
ARL1P40616 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms