Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN7P35236 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTPN7P35236 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTPN7P35236 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms