Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCKBRP32239 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CCKBRP32239 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms