Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HOXC12P31275 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
HOXC12P31275 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms