Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SSFA2P28290 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SSFA2P28290 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms